| Товар/услуги | Код КТРУ | Ед. изм. | Кол-во | Цена за ед. | Стоимость |
|---|---|---|---|---|---|
| Услуги по профессиональному обучению прочие Требования к содержанию стажировки - Работа в системе Navision, создание карточек животных; - Работа на автоматизированной сортировщике пробирок Atras – автоматический приём проб в лаборатории; - Ручной приём проб в лаборатории; - Маркировка, отбор и регистрация образцов; - Принцип и организация хранения биологического материала; - Учёт и отслеживание проб на этапе выделения ДНК, работа с различными видами журналов учёта образцов | 85.42.19.900 | Человек | 1 | 577777.92 | 577777.92 |
| Услуги по профессиональному обучению прочие Требования к содержанию стажировки 1 - Ознакомление с различными типами автоматизированных станций. Техника безопасности при работе на автоматизированных станциях. - Аликвотирование образцов, заполнение журнала регистрации проб. - Выделение ДНК из различных биоматериалов (кровь, выщипы, волосы, слюна и прочее) методами сорбции на фильтр-колонках и магнитных частицах. Использование автоматизированной станции Tecan Fluent; - Контроль качества образцов методами спектрофотометрии и флюориметрии. ПЦР в реальном времени, гель-электрофорез в агарозном геле; - Генотипирование на чипах средней плотности Illumina. Принцип и методика. - Амплификация образцов ДНК. Работа с автоматизированной станцией Freedom EVO и программным обеспечением кот Illumina. Учёт и отслеживание проб на этапах генотипирования. Знакомство с протоколом пробоподготовки Illumina; - Пробоподготовка на этапах пост амплификации. Фрагментация, преципитация, ресуспендирование, гибридизация на чипах. Окраска чипов Требования к содержанию стажировки 2 - Сканирование чипов. Оценка качества генотипирования. Работа в программном пакете, используемым для анализа и интерпретации больших объемов геномных данных. На платформе, которая позволяет пользователям быстро и легко визуализировать и интерпретировать данные. ПО способным интегрироваться с множеством других инструментов биоинформатики, что делает его идеальным выбором для крупномасштабного геномного анализа. - Работа с образцами, полученными для проведения экспертизы. Приём и регистрация образцов, подбор метода выделения ДНК, постановка ПЦР для определения вида животного, генотипирование. Биоинформатический анализ на определение породной принадлежности, поисков совпадений в базе данных и определение родственных связей. - Генотипирование методом микросателлитного анализа образцов КРС. Принцип метода. Выделение ДНК. Постановка анализа. Ознакомление с прибором GenAnalyzer 3500 и программным обеспечением к нему. Анализ результатов, расчёт родства. - ПЦР-тест система как альтернативный способ определения мутаций и метод валидации олигонуклеотидных зондов для «кастомизации» чипа | 85.42.19.900 | Человек | 1 | 551111.25 | 551111.25 |
| Услуги по профессиональному обучению прочие Требования к содержанию стажировки - Методы анализа результатов генотипирования на чипах средней и высокой плотности компании Illumina. Работа с программном пакете, используемым для анализа и интерпретации больших объемов геномных данных. На платформе, которая позволяет пользователям быстро и легко визуализировать и интерпретировать данные. ПО способным интегрироваться с множеством других инструментов биоинформатики, что делает его идеальным выбором для крупномасштабного геномного анализа. - Введение в биоинформатику: спектр задач и методы их решения. Применение биоинформатических подходов в селекции животных. - Технология генотипирование на чипах средней и высокой плотности компании Illumina. - Работа с биоинформационными базами данных, содержащих информацию о значимых изменениях в геномах животных. OMIA, NCBI. - Введение в Python. - Методы идентификации животных и определения родства. Выборка ICAR. - Методы расчета породной принадлежности. Admixture, PLINK. Способы выделения генетических линий. - Оценка племенной ценности животных на основе метода BLUP. Геномная оценка. - SQL в рамках работы базами данных, содержащих информацию о животных и их геномах. - Язык R для обработки и визуализации геномных и фенотипических данных, формирования аналитических отчетов. - Основы «Linux». | 85.42.19.900 | Человек | 1 | 567777.92 | 567777.92 |
| Услуги по профессиональному обучению прочие Требования к содержанию стажировки - Описание рабочего сервера (архитерктура, количество ядер, памяти и т.д.). - Виртуальные сервера для расчетов Задачи, для которых используются CPU/GPU сервера. - Опыт использования облачных серверов: сравнение мощностей, стабильности и скорости расчета | 85.42.19.900 | Человек | 1 | 584444.58 | 584444.58 |